Благодаря размерам страны биоразнообразие экосистем России можно по праву считать богатейшим на всей планете. На территории РФ располагается более 8 абсолютно не похожих друг на друга природных зон, начиная от ледяных пустынь и заканчивая плодородными степями. Россия является мировым лидером по площади лесов (809 млн га) - на территории страны находится 20,1% общей площади лесов мира. В настоящее время система особо охраняемых природных территорий России включает 102 государственных природных заповедника и 47 национальных парков. Тем не менее, проблемой является то, что с развитием хозяйственной деятельности экосистемы страны становятся все более фрагментированными, а система охраняемых территорий все более изолированной, поэтому увеличение площадей таких территорий зачастую не решает проблемы сохранения редких видов.

В результате активного антропогенного влияния экосистемы подвергаются загрязнению и деградации. Так, на территории России в общей сложности около 100 млн га земель подвергаются деградации, в год вырубается около 1,2 млн га леса, еще 800 тыс. га уничтожается нелегально. Во время печально известных лесных пожаров 2010 года в России сгорело 2,8 млн га леса. Некоторые виды животных находятся под угрозой вымирания из-за частых случаев браконьерства.

Для работы над решением важных проблем, связанных с деградацией экосистем, в России объединяются многие организации, создаются федеральные законы и программы по улучшению качества экосистем и поддержанию биоразнообразия местных природных зон.